Esto es un gif que he hecho con la aplicación GIMP.
Para hacer esto lo primero que debes hacer es crear un cuadrado o un rectángulo dependiendo de lo que quieras hacer de gif, para este hemos elegido un rectángulo y luego tenemos que en herramientas de pintura, elegir el degradado y elegir es que es de esos colores. Cuando ya tenemos eso, creamos varias capas y en cada una de ellas le hacemos variaciones, es decir cambiarlas con el elemento de deformación,diferentes quitandole la visibilidad a la de arriba para poder cambiar la de abajo y cuando ya las tenemos todas lo hacemos un gif.